重点实验室按照“开放、流动、联合、竞争”运行机制，利用设备及技术上优势，全面对外开放，已建设成为华南地区热带病防治研究、人才培养以及高科技成果产业化基地。目前，重点实验室主要研究方向包括以下五个方面：

研究方向1：新发突发及输入病原体溯源、监控和传播规律研究

研究方向2：烈性和重要慢性病毒的致病机制和防治技术研究

研究方向3：虫媒和重要寄生虫病防控关键技术研究

研究方向4：细菌和其它热带病原体耐药机制和耐药微生态研究

研究方向5：生物安全前沿技术与产品研究